Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms