Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.7 ms