Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms