Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EMX2Q04743 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EMX2Q04743 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EMX2Q04743 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EMX2Q04743 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EMX2Q04743 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms