Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYP27A1Q02318 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms