Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.9 ms