Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC17■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC17■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms