Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF3P78545 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF3P78545 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF3P78545 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF3P78545 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF3P78545 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF3P78545 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF3P78545 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF3P78545 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF3P78545 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF3P78545 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF3P78545 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF3P78545 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF3P78545 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF3P78545 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF3P78545 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF3P78545 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF3P78545 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF3P78545 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF3P78545 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF3P78545 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF3P78545 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF3P78545 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF3P78545 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF3P78545 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF3P78545 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF3P78545 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF3P78545 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF3P78545 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF3P78545 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF3P78545 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF3P78545 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF3P78545 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF3P78545 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF3P78545 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF3P78545 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF3P78545 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF3P78545 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF3P78545 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF3P78545 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF3P78545 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF3P78545 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF3P78545 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF3P78545 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF3P78545 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELF3P78545 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELF3P78545 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELF3P78545 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELF3P78545 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELF3P78545 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELF3P78545 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELF3P78545 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELF3P78545 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELF3P78545 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELF3P78545 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELF3P78545 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELF3P78545 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELF3P78545 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELF3P78545 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELF3P78545 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELF3P78545 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELF3P78545 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELF3P78545 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELF3P78545 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELF3P78545 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELF3P78545 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ELF3P78545 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELF3P78545 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ELF3P78545 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELF3P78545 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ELF3P78545 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELF3P78545 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELF3P78545 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELF3P78545 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELF3P78545 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELF3P78545 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELF3P78545 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELF3P78545 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELF3P78545 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELF3P78545 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELF3P78545 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELF3P78545 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELF3P78545 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELF3P78545 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELF3P78545 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ELF3P78545 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ELF3P78545 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ELF3P78545 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ELF3P78545 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ELF3P78545 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ELF3P78545 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ELF3P78545 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ELF3P78545 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ELF3P78545 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ELF3P78545 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ELF3P78545 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ELF3P78545 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ELF3P78545 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ELF3P78545 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ELF3P78545 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms