Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX1P78414 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX1P78414 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRX1P78414 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRX1P78414 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRX1P78414 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRX1P78414 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRX1P78414 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRX1P78414 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRX1P78414 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRX1P78414 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRX1P78414 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRX1P78414 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRX1P78414 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRX1P78414 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRX1P78414 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRX1P78414 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRX1P78414 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRX1P78414 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRX1P78414 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRX1P78414 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IRX1P78414 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IRX1P78414 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IRX1P78414 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRX1P78414 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRX1P78414 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRX1P78414 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRX1P78414 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRX1P78414 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRX1P78414 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRX1P78414 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRX1P78414 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRX1P78414 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRX1P78414 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRX1P78414 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRX1P78414 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRX1P78414 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRX1P78414 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRX1P78414 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRX1P78414 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRX1P78414 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRX1P78414 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRX1P78414 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRX1P78414 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRX1P78414 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IRX1P78414 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IRX1P78414 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IRX1P78414 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IRX1P78414 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IRX1P78414 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IRX1P78414 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IRX1P78414 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IRX1P78414 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IRX1P78414 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IRX1P78414 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IRX1P78414 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRX1P78414 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRX1P78414 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRX1P78414 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRX1P78414 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRX1P78414 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRX1P78414 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRX1P78414 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRX1P78414 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
IRX1P78414 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRX1P78414 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRX1P78414 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRX1P78414 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRX1P78414 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRX1P78414 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRX1P78414 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
IRX1P78414 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRX1P78414 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRX1P78414 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRX1P78414 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRX1P78414 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRX1P78414 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRX1P78414 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRX1P78414 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRX1P78414 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRX1P78414 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRX1P78414 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRX1P78414 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRX1P78414 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRX1P78414 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRX1P78414 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRX1P78414 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRX1P78414 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRX1P78414 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRX1P78414 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRX1P78414 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRX1P78414 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRX1P78414 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRX1P78414 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRX1P78414 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRX1P78414 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRX1P78414 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRX1P78414 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRX1P78414 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRX1P78414 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms