Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms