Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PGDP52209 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PGDP52209 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PGDP52209 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PGDP52209 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PGDP52209 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PGDP52209 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PGDP52209 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PGDP52209 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PGDP52209 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PGDP52209 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PGDP52209 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PGDP52209 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PGDP52209 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PGDP52209 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PGDP52209 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGDP52209 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGDP52209 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGDP52209 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGDP52209 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGDP52209 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PGDP52209 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGDP52209 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGDP52209 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGDP52209 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGDP52209 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGDP52209 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGDP52209 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGDP52209 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PGDP52209 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGDP52209 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGDP52209 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGDP52209 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGDP52209 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PGDP52209 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGDP52209 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGDP52209 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGDP52209 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGDP52209 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGDP52209 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGDP52209 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PGDP52209 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PGDP52209 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGDP52209 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGDP52209 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PGDP52209 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGDP52209 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PGDP52209 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGDP52209 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGDP52209 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGDP52209 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGDP52209 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGDP52209 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGDP52209 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGDP52209 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGDP52209 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGDP52209 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGDP52209 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGDP52209 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGDP52209 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGDP52209 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PGDP52209 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGDP52209 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGDP52209 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGDP52209 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGDP52209 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGDP52209 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGDP52209 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGDP52209 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGDP52209 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGDP52209 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGDP52209 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGDP52209 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGDP52209 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGDP52209 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGDP52209 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGDP52209 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGDP52209 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PGDP52209 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGDP52209 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PGDP52209 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGDP52209 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGDP52209 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGDP52209 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGDP52209 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGDP52209 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGDP52209 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGDP52209 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGDP52209 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGDP52209 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PGDP52209 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGDP52209 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGDP52209 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PGDP52209 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGDP52209 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGDP52209 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGDP52209 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGDP52209 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PGDP52209 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGDP52209 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms