Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms