Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
CRIP1P50238 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
CRIP1P50238 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
CRIP1P50238 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
CRIP1P50238 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
CRIP1P50238 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
CRIP1P50238 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
CRIP1P50238 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
CRIP1P50238 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
CRIP1P50238 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
CRIP1P50238 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
CRIP1P50238 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
CRIP1P50238 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
CRIP1P50238 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
CRIP1P50238 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
CRIP1P50238 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
CRIP1P50238 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
CRIP1P50238 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
CRIP1P50238 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
CRIP1P50238 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
CRIP1P50238 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
CRIP1P50238 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
CRIP1P50238 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
CRIP1P50238 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
CRIP1P50238 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
CRIP1P50238 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC11.71□□□□□ -0.53
CRIP1P50238 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
CRIP1P50238 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
CRIP1P50238 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
CRIP1P50238 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC11.71□□□□□ -0.53
CRIP1P50238 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
CRIP1P50238 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
CRIP1P50238 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
CRIP1P50238 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
CRIP1P50238 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms