Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms