Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GCLMP48507 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GCLMP48507 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GCLMP48507 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GCLMP48507 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GCLMP48507 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GCLMP48507 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCLMP48507 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCLMP48507 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GCLMP48507 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCLMP48507 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCLMP48507 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCLMP48507 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCLMP48507 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCLMP48507 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCLMP48507 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCLMP48507 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCLMP48507 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCLMP48507 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCLMP48507 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCLMP48507 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCLMP48507 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCLMP48507 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCLMP48507 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCLMP48507 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCLMP48507 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCLMP48507 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GCLMP48507 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GCLMP48507 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GCLMP48507 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GCLMP48507 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCLMP48507 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCLMP48507 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCLMP48507 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCLMP48507 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GCLMP48507 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCLMP48507 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCLMP48507 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCLMP48507 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCLMP48507 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCLMP48507 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCLMP48507 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCLMP48507 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCLMP48507 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCLMP48507 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCLMP48507 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCLMP48507 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCLMP48507 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCLMP48507 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCLMP48507 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCLMP48507 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCLMP48507 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCLMP48507 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCLMP48507 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCLMP48507 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCLMP48507 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCLMP48507 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCLMP48507 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCLMP48507 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCLMP48507 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCLMP48507 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCLMP48507 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCLMP48507 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCLMP48507 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCLMP48507 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCLMP48507 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GCLMP48507 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCLMP48507 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCLMP48507 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCLMP48507 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCLMP48507 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCLMP48507 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GCLMP48507 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GCLMP48507 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GCLMP48507 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GCLMP48507 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GCLMP48507 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
GCLMP48507 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GCLMP48507 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GCLMP48507 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GCLMP48507 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GCLMP48507 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GCLMP48507 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCLMP48507 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCLMP48507 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCLMP48507 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCLMP48507 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCLMP48507 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCLMP48507 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCLMP48507 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCLMP48507 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GCLMP48507 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCLMP48507 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCLMP48507 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCLMP48507 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCLMP48507 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCLMP48507 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCLMP48507 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCLMP48507 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCLMP48507 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms