Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms