Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNMT1P26358 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNMT1P26358 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNMT1P26358 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNMT1P26358 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNMT1P26358 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNMT1P26358 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNMT1P26358 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNMT1P26358 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
DNMT1P26358 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNMT1P26358 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNMT1P26358 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNMT1P26358 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
DNMT1P26358 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNMT1P26358 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNMT1P26358 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNMT1P26358 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
DNMT1P26358 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
DNMT1P26358 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNMT1P26358 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
DNMT1P26358 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNMT1P26358 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNMT1P26358 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNMT1P26358 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNMT1P26358 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNMT1P26358 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNMT1P26358 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNMT1P26358 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC23■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC23■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC23■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC23■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC23■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC23■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC23■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms