Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
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PTPRBP23467 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
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PTPRBP23467 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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PTPRBP23467 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
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PTPRBP23467 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
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PTPRBP23467 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
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