Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms