Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EPB42P16452 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPB42P16452 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPB42P16452 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPB42P16452 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPB42P16452 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPB42P16452 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPB42P16452 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPB42P16452 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPB42P16452 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPB42P16452 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPB42P16452 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPB42P16452 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPB42P16452 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPB42P16452 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPB42P16452 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPB42P16452 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPB42P16452 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPB42P16452 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPB42P16452 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPB42P16452 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EPB42P16452 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPB42P16452 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EPB42P16452 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EPB42P16452 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EPB42P16452 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPB42P16452 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPB42P16452 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPB42P16452 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPB42P16452 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPB42P16452 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPB42P16452 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPB42P16452 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPB42P16452 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EPB42P16452 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPB42P16452 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPB42P16452 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPB42P16452 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPB42P16452 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPB42P16452 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPB42P16452 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPB42P16452 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPB42P16452 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPB42P16452 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPB42P16452 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPB42P16452 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPB42P16452 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPB42P16452 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPB42P16452 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPB42P16452 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPB42P16452 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPB42P16452 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPB42P16452 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPB42P16452 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPB42P16452 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPB42P16452 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPB42P16452 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPB42P16452 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPB42P16452 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPB42P16452 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPB42P16452 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPB42P16452 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPB42P16452 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPB42P16452 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPB42P16452 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPB42P16452 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPB42P16452 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPB42P16452 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPB42P16452 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPB42P16452 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPB42P16452 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPB42P16452 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPB42P16452 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPB42P16452 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPB42P16452 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPB42P16452 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPB42P16452 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPB42P16452 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPB42P16452 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPB42P16452 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPB42P16452 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPB42P16452 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EPB42P16452 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPB42P16452 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPB42P16452 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPB42P16452 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPB42P16452 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPB42P16452 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPB42P16452 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPB42P16452 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPB42P16452 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EPB42P16452 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EPB42P16452 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPB42P16452 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPB42P16452 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPB42P16452 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPB42P16452 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPB42P16452 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPB42P16452 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EPB42P16452 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms