Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 AC138150.1-201ENST00000589950 570 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 AC020658.4-201ENST00000613987 684 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 GIMAP7-201ENST00000313543 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 PTP4A2-201ENST00000457805 1032 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 AC024267.5-201ENST00000579154 599 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms