Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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CLDN9O95484 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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CLDN9O95484 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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