Protein–RNA interactions for Protein: O43900

PRICKLE3, Prickle planar cell polarity protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRICKLE3O43900 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms