Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 AC132872.1-201ENST00000566986 1195 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP9BO43861 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP9BO43861 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP9BO43861 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP9BO43861 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP9BO43861 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP9BO43861 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP9BO43861 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP9BO43861 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP9BO43861 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP9BO43861 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP9BO43861 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP9BO43861 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP9BO43861 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 266 ms