Protein–RNA interactions for Protein: O00507

USP9Y, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-Y, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YO00507 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
USP9YO00507 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP9YO00507 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP9YO00507 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP9YO00507 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP9YO00507 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP9YO00507 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP9YO00507 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP9YO00507 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
USP9YO00507 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP9YO00507 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP9YO00507 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP9YO00507 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP9YO00507 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP9YO00507 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP9YO00507 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP9YO00507 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP9YO00507 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP9YO00507 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP9YO00507 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP9YO00507 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP9YO00507 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP9YO00507 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP9YO00507 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP9YO00507 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9YO00507 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9YO00507 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9YO00507 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9YO00507 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9YO00507 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9YO00507 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9YO00507 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9YO00507 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9YO00507 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9YO00507 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9YO00507 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9YO00507 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9YO00507 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9YO00507 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9YO00507 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9YO00507 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9YO00507 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9YO00507 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9YO00507 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9YO00507 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9YO00507 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9YO00507 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9YO00507 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9YO00507 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9YO00507 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9YO00507 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9YO00507 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9YO00507 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9YO00507 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9YO00507 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9YO00507 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9YO00507 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9YO00507 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9YO00507 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9YO00507 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9YO00507 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9YO00507 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9YO00507 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9YO00507 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9YO00507 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9YO00507 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9YO00507 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9YO00507 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9YO00507 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9YO00507 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9YO00507 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9YO00507 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
USP9YO00507 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
USP9YO00507 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
USP9YO00507 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
USP9YO00507 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
USP9YO00507 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
USP9YO00507 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
USP9YO00507 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
USP9YO00507 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
USP9YO00507 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
USP9YO00507 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
USP9YO00507 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
USP9YO00507 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
USP9YO00507 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP9YO00507 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP9YO00507 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP9YO00507 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP9YO00507 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP9YO00507 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP9YO00507 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP9YO00507 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP9YO00507 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP9YO00507 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP9YO00507 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP9YO00507 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP9YO00507 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP9YO00507 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP9YO00507 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP9YO00507 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms