Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms