Protein–RNA interactions for Protein: A4FU69

EFCAB5, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB5A4FU69 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
EFCAB5A4FU69 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms