Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms