Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms