Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms