Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2IRD1Q9UHL9 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2IRD1Q9UHL9 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2IRD1Q9UHL9 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2IRD1Q9UHL9 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2IRD1Q9UHL9 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2IRD1Q9UHL9 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2IRD1Q9UHL9 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2IRD1Q9UHL9 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2IRD1Q9UHL9 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2IRD1Q9UHL9 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2IRD1Q9UHL9 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2IRD1Q9UHL9 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2IRD1Q9UHL9 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2IRD1Q9UHL9 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2IRD1Q9UHL9 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2IRD1Q9UHL9 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2IRD1Q9UHL9 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2IRD1Q9UHL9 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2IRD1Q9UHL9 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2IRD1Q9UHL9 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2IRD1Q9UHL9 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2IRD1Q9UHL9 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2IRD1Q9UHL9 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2IRD1Q9UHL9 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2IRD1Q9UHL9 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2IRD1Q9UHL9 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2IRD1Q9UHL9 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2IRD1Q9UHL9 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2IRD1Q9UHL9 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2IRD1Q9UHL9 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2IRD1Q9UHL9 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2IRD1Q9UHL9 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2IRD1Q9UHL9 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2IRD1Q9UHL9 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2IRD1Q9UHL9 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2IRD1Q9UHL9 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2IRD1Q9UHL9 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2IRD1Q9UHL9 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2IRD1Q9UHL9 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2IRD1Q9UHL9 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2IRD1Q9UHL9 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2IRD1Q9UHL9 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2IRD1Q9UHL9 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2IRD1Q9UHL9 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2IRD1Q9UHL9 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2IRD1Q9UHL9 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2IRD1Q9UHL9 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2IRD1Q9UHL9 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2IRD1Q9UHL9 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2IRD1Q9UHL9 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2IRD1Q9UHL9 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2IRD1Q9UHL9 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2IRD1Q9UHL9 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2IRD1Q9UHL9 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2IRD1Q9UHL9 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2IRD1Q9UHL9 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2IRD1Q9UHL9 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2IRD1Q9UHL9 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2IRD1Q9UHL9 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2IRD1Q9UHL9 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2IRD1Q9UHL9 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms