Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms