Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms