Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNK4Q9NYG8 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms