Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVK-5Q9HDB9 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms