Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRHQ9HD43 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRHQ9HD43 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRHQ9HD43 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRHQ9HD43 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRHQ9HD43 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRHQ9HD43 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRHQ9HD43 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRHQ9HD43 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRHQ9HD43 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRHQ9HD43 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRHQ9HD43 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRHQ9HD43 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRHQ9HD43 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRHQ9HD43 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRHQ9HD43 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRHQ9HD43 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRHQ9HD43 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRHQ9HD43 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRHQ9HD43 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRHQ9HD43 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRHQ9HD43 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRHQ9HD43 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRHQ9HD43 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRHQ9HD43 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRHQ9HD43 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRHQ9HD43 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRHQ9HD43 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRHQ9HD43 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRHQ9HD43 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRHQ9HD43 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRHQ9HD43 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRHQ9HD43 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRHQ9HD43 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRHQ9HD43 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRHQ9HD43 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRHQ9HD43 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRHQ9HD43 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRHQ9HD43 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRHQ9HD43 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRHQ9HD43 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRHQ9HD43 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRHQ9HD43 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRHQ9HD43 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRHQ9HD43 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms