Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms