Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms