Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms