Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms