Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms