Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms