Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW6

SMIM2, Small integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM2Q9BVW6 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM2Q9BVW6 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms