Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms