Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms