Protein–RNA interactions for Protein: Q99607

ELF4, ETS-related transcription factor Elf-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF4Q99607 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms