Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms