Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms