Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms