Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms